Neben der klassischen Entzündung z.B. im Rahmen einer Erkältung können aber auch entzündete Zähne zu einer Erkrankung der Kieferhöhle führen. Eine genaue Abklärung, insbesondere bei wiederholt auftretenden Entzündungen (Sinusitis) ist wichtig. 

Andere Krankheitsbilder der Kieferhöhle sind Zysten und gut- bzw. bösartige Tumoren. Auch diese werden durch den Kiefer- und Gesichtschirurgen, in der Regel in Zusammenarbeit mit anderen Fachärzten diagnostiziert und behandelt.
Sehr häufig werden durch den Kiefer- Gesichtschirurgen Kieferhöhlenfisteln zur Mundhöhle gesehen. Diese sind häufig Folge einer Zahnentfernung im Oberkiefer und erfordern eine chirurgische Behandlung zum Verschluss der Fistel. In einigen Fällen kann zusätzlich die chirurgische Sanierung der betroffenen Kieferhöhle notwendig sein.